Hanneman od 2011 roku przechodził rehabilitację po pozornie niewinnym ukąszeniu pająka, które było przyczyną niezwykle rzadkiej choroby - martwiczego zapalenia powięzi, objawiającego się obumieraniem zaatakowanych organów wewnętrznych lub całych partii mięśni. Lekarze stoczyli walkę o uratowanie ręki muzyka.
Po leczeniu i rehabilitacji Hanneman wydawał się wracać do zdrowia, jednak choroba wywołała wiele poważnych powikłań, między innymi niewydolność wątroby, która była bezpośrednią przyczyną śmierci muzyka.
Nowy styl - thrash metal
Jeff Hanneman był jednym z założycieli kalifornijskiej grupy thrashmetalowej Slayer. Formacja powstała w 1981 roku w położonej pod Los Angeles miejscowości Huntington Park, gdzie Hanneman na przesłuchaniu muzyków do lokalnej formacji poznał - również grającego na gitarze - Kerry'ego Kinga. Założony przez nich Slayer szybko stał się sensacją na scenie metalowej, a charakterystyczny sposób grania dał początek nowemu stylowi - thrash metalowi.
W 2004 roku muzyk wraz z Kerrym Kingiem został sklasyfikowany na 10. miejscu listy 100 najlepszych gitarzystów heavymetalowych wszech czasów według magazynu Guitar World.